Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COPG2Q9UBF2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms