Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ORC3Q9UBD5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms