Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL13Q9P2N7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms