Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms