Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms