Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms