Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms