Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP4R2Q9NY27 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP4R2Q9NY27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms