Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC25Q9NXE8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms