Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM248Q9NWD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM248Q9NWD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms