Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPMQ9NSP4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms