Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms