Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms