Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS45Q9NRW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS45Q9NRW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms