Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms