Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TULP4Q9NRJ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms