Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms