Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTORQ9NRC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms