Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms