Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms