Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUFT1Q9NNX1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms