Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms