Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP44Q9H0E7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms