Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms