Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms