Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF1Q9BZW5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF1Q9BZW5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms