Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms