Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCAPERQ9BY12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms