Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms