Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RIOK2Q9BVS4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms