Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSEN34Q9BSV6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSEN34Q9BSV6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms