Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms