Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM7Q9BQ49 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM7Q9BQ49 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms