Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MEIS3Q99687 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms