Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3CQ99613 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms