Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.4 ms