Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYCBPQ99417 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms