Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALS2Q96Q42 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALS2Q96Q42 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms