Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms