Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC7Q96NW7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms