Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms