Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT74Q96LB3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT74Q96LB3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms