Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK3Q96L96 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms