Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX27Q96L92 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms