Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD1Q96JS3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms