Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP36Q96G28 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP36Q96G28 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms