Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC10A4Q96EP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC10A4Q96EP9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms