Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OPTNQ96CV9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPTNQ96CV9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms