Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUNDC1Q96C34 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms