Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RFT1Q96AA3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms